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Microbiote et microbiome : comprendre et préserver nos alliés invisibles

vogot Par Le 09/10/2025 0

Le microbiote et le microbiome sont au cœur de la recherche scientifique et de la naturopathie. Ils influencent notre digestion, notre immunité, nos émotions et même notre longévité.

Comprendre leur rôle et savoir comment les préserver est essentiel pour maintenir un équilibre durable entre santé physique et bien-être global.

Microbiote et microbiome : quelle différence ?

Le microbiote désigne l’ensemble des micro-organismes (bactéries, levures, virus, champignons) vivant dans un environnement donné, comme l’intestin. Le microbiome, lui, correspond à l’ensemble des gènes de ces micro-organismes. Autrement dit, le microbiote est la population, et le microbiome son patrimoine génétique.

Un écosystème complexe

Le corps humain abrite plusieurs microbiotes : intestinal, cutané, buccal, vaginal, pulmonaire. Chacun joue un rôle spécifique et interagit avec les autres. Le microbiote intestinal est le plus étudié, mais les autres ne doivent pas être négligés.

Un rôle central pour la santé

Le microbiote intestinal participe à :

  • la digestion et l’absorption des nutriments,
  • la production de vitamines (K, B12, folates),
  • la régulation du système immunitaire,
  • la synthèse de neurotransmetteurs comme la sérotonine,
  • la protection contre les agents pathogènes.

Microbiote et émotions

On parle aujourd’hui de l’axe intestin-cerveau. Les bactéries intestinales influencent la production de sérotonine et de dopamine, impactant directement nos humeurs. Un déséquilibre du microbiote peut favoriser anxiété, dépression ou troubles du sommeil.

Facteurs de déséquilibre

Plusieurs éléments fragilisent le microbiote :

  • alimentation trop riche en sucres et produits ultra-transformés,
  • prise répétée d’antibiotiques,
  • stress chronique,
  • manque de fibres alimentaires,
  • pollution et perturbateurs endocriniens.

Microbiote et maladies chroniques

Un microbiote déséquilibré est associé à de nombreuses pathologies :

  • obésité et diabète de type 2,
  • maladies inflammatoires chroniques de l’intestin,
  • maladies auto-immunes,
  • cancers digestifs,
  • troubles neurologiques (Parkinson, Alzheimer).

Comment préserver son microbiote ?

La prévention repose sur des gestes simples :

  • Privilégier une alimentation riche en fibres (fruits, légumes, légumineuses, céréales complètes).
  • Introduire des aliments fermentés (choucroute, kéfir, kombucha, miso, yaourt nature).
  • Limiter les sucres raffinés et les produits industriels.
  • Pratiquer une activité physique régulière.
  • Réduire le stress par la respiration, la méditation ou le yoga.
  • Favoriser un sommeil réparateur.

Microbiote et naturopathie

En naturopathie, le microbiote est considéré comme un pilier de la santé. Soutenir sa diversité bactérienne, c’est renforcer l’immunité, améliorer la digestion et prévenir de nombreuses maladies chroniques. Les thérapeutes recommandent souvent des cures de probiotiques et prébiotiques adaptés, associés à une hygiène de vie globale.

Conclusion et conseils pratiques

Le microbiote et le microbiome sont des alliés invisibles mais essentiels. Leur équilibre conditionne notre vitalité, notre immunité et même notre équilibre émotionnel.

Pour les préserver au quotidien :

  • Mangez varié, coloré et riche en fibres.
  • Ajoutez régulièrement des aliments fermentés à vos repas.
  • Évitez les excès de sucre et d’alcool.
  • Pratiquez une activité physique douce et régulière.
  • Apprenez à gérer le stress et à cultiver des émotions positives.

Prendre soin de son microbiote, c’est investir dans une santé durable et un bien-être global.

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